Plateformes de l'unité

genobirdLabellisée Biogenouest et IBiSA.
Coordinateurs : Richard Redon et Solena Le Scouarnec

Les deux plates-formes qui composent GenoBiRD proposent un service complet pour mener à bien des projets de séquençage, de génotypage et d'analyse d'expression des génomes, partant de la paillasse jusqu'à l'analyse des données. Elles proposent également la mise à disposition de ressources (équipements, cluster de calcul...)

Plateforme de Génomique

Responsable technique : Stéphanie Bonnaud
La plateforme fait partie du réseau Biogenouest Génomique.

  • séquençage massif (NGS) : génomes ou exomes entiers, capture de gènes ciblés.
  • séquencage capillaire
  • génotypage haut-débit (sur puces Affymetrix Axiom)
  • étude du transcriptome par puces à ADN ou par RNA-seq
INFORMATION IMPORTANTE
Attention, arrêt de l'activité séquençage et génotypage capillaire: derniers dépôts d'échantillons le 17/12/2018


Personnel :
Marine Cornec
Valentin Crusson
Audrey Donnart
Béatrice Le Ray

Plateforme Bioinformatique

Responsable technique : Audrey Bihouée
La plateforme fait partie du réseau IFB-GO.

BiRD conseille, propose et développe des services en bioinformatique :
  • un accompagnement des projets d'analyse de données en génomique
  • la mise à disposition des ressources pour la bioinformatique
  • des formations courtes

BiRD possède une expertise dans l'analyse de données à grande échelle et développe des pipelines bioinformatiques dédiés permettant de standardiser l’analyse.

Personnel :
Solenne Dumont
Éric Charpentier
Alban Gaignard
Jean-François Guillaume
Raluca Teusan

Consulter le site WEB 

Therassay
Labellisée Biogenouest et IBiSA.
Coordinateur : Flavien Charpentier
Responsable technique : Maud Chétiveaux

THERASSAY, est une structure nantaise d’exploration des fonctions et des pathologies sur le petit animal qui s’appuie sur l’expertise d’équipes de recherche reconnues pour:

  • Valider à un niveau pré-clinique de nouvelle cible d’intérêt thérapeutique
  • Evaluer des effets thérapeutiques ou protecteurs de molécules ou de composés alimentaires
  • Caractériser des effets fonctionnels d’un produit : identifier et comprendre son action, trouver le ou les organes cibles, définir les doses actives

La plate-forme Therassay est labellisée par le réseau national des plates-formes IBiSA, est intégrée au réseau Biogenouest et reçoit le soutien de la région des Pays de la Loire.

Grâce aussi au soutien de CAPACITES SAS, filiale privée de l’Université de Nantes, THERASSAY offre une réactivité de société privée dans l’accompagnement des contrats de recherche partenariale entre acteurs privés et laboratoires universitaires.

La plate-forme Therassay est certifiée ISO 9001:2015 pour ces activités de projets d’exploration fonctionnelle.

Plateforme hébergée dans l'unité

Coordinateur : Laurent David
Responsable technique : Aude Derevier

La plate-forme iPSC (induced pluripotent stem cells) est actuellement hébergée dans les locaux de l'unité de recherche de l'institut du thorax. Elle a pour objectif de fournir à l'ensemble des laboratoires ligériens des iPSC humaines issues de sujets sains et de patients atteints de maladies génétiques complexes afin de créer des modèles physiopathologiques pertinents pour ces maladies. Les premiers projets de la plateforme iPSC concernent les cardiomyocytes dérivés des iPSC pour l'étude des troubles du rythme cardiaque et les hépatocytes dérivés des iPSC pour l'étude des dyslipidémies.

Relations fonctionnelles