Equipe Emergente
© Christian Chauvet - Avril 2018 - Bords de Loire - Nantes

Notre recherche

Notre activité de recherche menée au sein du service de génétique médicale du CHU de Nantes se fait en lien avec l’unité de recherche de l’institut du thorax depuis plusieurs années.
Ces fortes collaborations nous ont conduit à intégrer l’unité en tant qu’équipe émergente en février 2018.
Notre objectif est de développer une recherche fonctionnelle sur les gènes identifiés par les approches exome ou génome dans le contexte des maladies neuro-développementales et des érythrocytoses héréditaires.

 

Nos principaux programmes de recherche

  • Identification et compréhension de nouveaux mécanismes des causes génétiques de déficiences intellectuelles isolées ou syndromiques (S. Bézieau)

La déficience intellectuelle (DI) est une caractéristique fondamentale des troubles neuro-développementaux causés par des altérations génétiques dans plus de 50% des cas. Au cours des dernières années, un nombre croissant de mutations dans des gènes codant pour des protéines du système ubiquitine-protéasome (UPS) a été trouvé chez des patients présentant une DI. Notre équipe a identifié plusieurs gènes impliqués dans cette voie par des études de séquençage haut-débit (exomes).
Notre objectif principal est de continuer l'identification de nouveaux gènes responsables de DI par notre recrutement clinique et l’utilisation de l’exome en diagnostic, afin de sélectionner plus particulièrement les gènes impliqués dans le système UPS pour des études fonctionnelles. Nous voulons entrouvrir la piste de nouvelles approches thérapeutiques qui pourraient être testées dans nos modèles cellulaires et animaux que nous allons développer.

  • Identification et compréhension des causes génétiques des érythrocytoses héréditaires (porté par Betty Gardie)

Le but de ce projet est d'identifier les anomalies génétiques de patients atteints d'érythrocytose héréditaire et de comprendre les mécanismes en jeu dans la survenue des complications.

Il se divise en 5 groupes de travail:

  • Recrutement de patients en France et Europe (F. Girodon)
  • Diagnostic moléculaire (S. Bézieau)
  • Whole exome sequencing chez les patients non mutés et identification de nouveaux variants (R. Redon)
  • Validation fonctionnelle des variants de la voie de l'hypoxie in vitro (B. Gardie) et in cellulo avec un modèle iPS (en collaboration avec K. Si-Tayeb)
  • Validation fonctionnelle in vivo (modèle Zebrafish).

Les publications récentes de l'équipe


Küry S, Besnard T, Ebstein F, Khan TN, Gambin T, Douglas J, Bacino CA, Sanders SJ, Lehmann A, Latypova X, Khan K, Pacault M, Sacharow S, Glaser K, Bieth E,Perrin-Sabourin L, Jacquemont ML, Cho MT, Roeder E, Denommé-Pichon AS, Monaghan KG, Yuan B, Xia F, Simon S, Bonneau D, Parent P, Gilbert-Dussardier B, Odent S,Toutain A, Pasquier L, Barbouth D, Shaw CA, Patel A, Smith JL, Bi W, Schmitt S,Deb W, Nizon M, Mercier S, Vincent M, Rooryck C, Malan V, Briceño I, Gómez A,Nugent KM, Gibson JB, Cogné B, Lupski JR, Stessman HA, Eichler EE, Retterer K,Yang Y, Redon R, Katsanis N, Rosenfeld JA, Kloetzel PM, Golzio C, Bézieau S,Stankiewicz P, Isidor B.
De Novo Disruption of the Proteasome Regulatory Subunit PSMD12 Causes a Syndromic Neurodevelopmental Disorder.
Am J Hum Genet. 2017 Feb 2;100(2):352-363.

Petrovski S, Küry S, Myers CT, Anyane-Yeboa K, Cogné B, Bialer M, Xia F, Hemati P, Riviello J, Mehaffey M, Besnard T, Becraft E, Wadley A, Politi AR, Colombo S, Zhu X, Ren Z, Andrews I, Dudding-Byth T, Schneider AL, Wallace G; University of Washington Center for Mendelian Genomics., Rosen AB, Schelley S, Enns GM, Corre P, Dalton J, Mercier S, Latypova X, Schmitt S, Guzman E, Moore C,  Bier L, Heinzen EL, Karachunski P, Shur N, Grebe T, Basinger A, Nguyen JM, Bézieau S, Wierenga K, Bernstein JA, Scheffer IE, Rosenfeld JA, Mefford HC, Isidor B, Goldstein DB.
Germline De Novo Mutations in GNB1 Cause Severe Neurodevelopmental Disability, Hypotonia, and Seizures.
Am J Hum Genet. 2016 May 5;98(5):1001-10.

Isidor B, Küry S, Rosenfeld JA, Besnard T, Schmitt S, Joss S, Davies SJ, LebelRR, Henderson A, Schaaf CP, Streff HE, Yang Y, Jain V, Chida N, Latypova X, Le Caignec C, Cogné B, Mercier S, Vincent M, Colin E, Bonneau D, Denommé AS, Parent P, Gilbert-Dussardier B, Odent S, Toutain A, Piton A, Dina C, Donnart A, Lindenbaum P, Charpentier E, Redon R, Iemura K, Ikeda M, Tanaka K, Bézieau S.
De Novo Truncating Mutations in the Kinetochore-Microtubules Attachment Gene CHAMP1 Cause Syndromic Intellectual Disability.
Hum Mutat. 2016 Apr;37(4):354-8.

Gardie B, Percy MJ, Hoogewijs D, Chowdhury R, Bento C, Arsenault PR, Richard S, Almeida H, Ewing J, Lambert F, McMullin MF, Schofield CJ, Lee FS.
The role of PHD2 mutations in the pathogenesis of erythrocytosis.
Hypoxia (Auckl) 2014;2:71–90.
 
Bento C, Percy MJ, Gardie B, Maia TM, van Wijk R, Perrotta S, Della Ragione F, Almeida H, Rossi C, Girodon F, Aström M, Neumann D, Schnittger S, Landin B, Minkov M, Randi ML, Richard S, Casadevall N, Vainchenker W, Rives S, Hermouet S, Ribeiro ML, McMullin MF, Cario H, ECE-Consortium, Chauveau A, Gimenez-Roqueplo A-P, Bressac-de-Paillerets B, Altindirek D, et al.
Genetic basis of congenital erythrocytosis: mutation update and online databases.
Hum Mutat 2014;35:15–26.
 
Couvé S, Ladroue C, Laine E, Mahtouk K, Guégan J, Gad S, Le Jeune H, Le Gentil M, Nuel G, Kim WY, Lecomte B, Pagès J-C, Collin C, Lasne F, Benusiglio PR, Bressac-de Paillerets B, Feunteun J, Lazar V, Gimenez-Roqueplo A-P, Mazure NM, Dessen P, Tchertanov L, Mole DR, Kaelin W, Ratcliffe P, Richard S, Gardie B.
Genetic evidence of a precisely tuned dysregulation in the hypoxia signaling pathway during oncogenesis.
Cancer Res 2014;74:6554–6564.