Ingénieur.e données/connaissances clinico-génomiques

L'équipe I - Génétique Humaine et  la plateforme BiRD de l’unité de recherche de l’institut du thorax recrutent un.e ingénieur.e données/connaissances clinico-génomiques

La personne recrutée aura pour mission (1) de créer un démonstrateur technologique sécurisé basé sur des données simulées qui s'appuie sur les standards internationaux pour la découvrabilité et le partage de données phénotypiques et génomiques, et (2) de préparer son déploiement dans une infrastructure hospitalière certifiée HDS pour des jeux de données réels produits dans le contexte de NeuroVasc.

Cet accompagnement consistera à :

1. Échanger avec les experts cliniciens, biologistes, bioinformaticiens et bio-statisticiens afin de formaliser les besoins d’échange et d’intégration de données
2. Concevoir et développer des workflows de simulation de données cliniques et génomiques
3. Contribuer à un état de l’art sur les standards facilitant l’échange de données biomédicales (phénotypes, génomique)
4. Contribuer à la découvrabilité des jeux de données NeuroVasc en s’appuyant sur les ontologies de référence
5.  Concevoir et développer un démonstrateur web de découverte et partage de données de génomique / phénotypes FAIR

• Durée : 12 à 18 mois
• Fiche de poste détaillée
• Candidature : envoyer CV et lettre de motivation à Alban Gaignard et Audrey Bihouée
• Date limite de candidature : 13 novembre 2023
• Date de prise de fonction : 1er janvier 2024