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  • Le 07 December 2022
    Amphi Denis Escande
     
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  • 14h00

Titre de la thèse : High-throughput screening of spider venom for the identification of active compound in sodium channels

Equipe

Team II - Ion channels and cardiopathies


Directeur de thèse

Michel DE WAARD

Co-directeur de thèse

Rémy BEROUD

Rapporteurs

Dr Sébastien DUTERTRE, PhD, chargé de recherche, Institut des Biomolécules Max Mouseron, Montpellier
Dr Denis SERVENT, PhD,  directeur de recherche, CEA Gif sur Yvette, SIMoS

Examinatrices

Dr Isabelle BARO, PhD, directrice de recherche, Institut du Thorax Inserm UMR 1087/CNRS UM 6291
Dr Evelyne BENOIT, PhD, chargée de recherche, CEA Gif sur Yvette, SIMoS

Invité

Dr Rémy BEROUD, PhD, CEO, Smartox, Biotechnology, Grenoble

 

Abstract

Les dysfonctionnements des canaux sodiques voltage-dépendants (Nav) ont été associés à de nombreuses pathologies telles que les maladies cardiaques, les douleurs neuropathiques, l'épilepsie et les paralysies musculaires. Afin d'étudier le rôle de ces canaux dans les maladies, de restaurer leur fonction ou de créer un modèle pour ces pathologies, des molécules spécifiques ciblant les canaux ioniques sont nécessaires. Les molécules hautement spécifiques pour une isoforme donnée du canal sodique sont difficiles à découvrir avec les bibliothèques chimiques habituelles. Les venins d'animaux, et en particulier les venins d'araignées, contiennent une dizaine de peptides agissant sur les canaux ioniques et représentent donc des bibliothèques intéressantes pour la découverte de médicaments. En criblant des venins d'araignées sur Nav, nous avons cherché à identifier de nouvelles toxines ciblant spécifiquement une isoforme de canal à l'aide d'une technique de patch-clamp automatisé (APC) (SyncroPatch364, Nanion). Pour cela, tous les venins ont été préalablement fractionnés en bibliothèques et testés sur plusieurs lignées cellulaires Nav stables (Nav1.3, Nav1.4, Nav1.5 et Nav1.6). L'APC permet d'accélérer le processus de découverte de médicaments. Les fractions d'intérêt sont celles qui réduisent le courant au pic de sodium, ralentissent l'inactivation ou augmentent le courant de sodium tardif. Après de nombreux fractionnements et purifications jusqu’à arriver à un peptide unique, 35 peptides actifs sur au moins une isoforme ont été sélectionnés pour être séquencés puis synthétisés chimiquement. Parallèlement j’ai participé à la recherche de sélectivité d’un autre peptide issu d’un venin d’araignée actif sur la cible de douleur Nav1.7 mais interagissant également sur Nav1.6 présent au niveau présynaptique. J’ai également effectué la relation structure-activité (SAR) d’un peptide issu d’un criblage précédent actif sur Nav1.1 impliqué dans l’épilepsie.