Thesis defense Kevin Riquin

Le diagnostic moléculaire des troubles neurodéveloppementaux (TND) repose encore principalement sur le séquençage d’exome, avec un rendement diagnostique plafonnant à 31 % pour les TND isolés et 53 % pour les TND syndromiques. Le séquençage de génome (SG) a montré de meilleures performances mais sa mise en œuvre systématique en diagnostic pose de nouveaux défis, notamment en ce qui concerne la détection et l'interprétation des variants structuraux (SV) ou des variants localisés dans des régions non codantes. Nous avons montré que l'application de techniques omiques complémentaires, telles que le RNA-Seq clinique et la cartographie optique du génome, contribuent à améliorer le rendement diagnostique du séquençage du génome pour des cas complexes ou difficiles à interpréter.

Notre étude confirme que, sur la base du SG seul, certains SV n’auraient pas été retenus comme pathogènes/candidats et qu’il aurait été difficile de poser les hypothèses mécanistiques pour les événements complexes. Par ailleurs, nous avons identifié et rapporté une délétion du long ARN non codant régulateur CHASERR que nous associons à un nouveau TND syndromique. Le RNA-Seq clinique et les techniques de séquençage long fragments sont des sujets de recherche en pleine expansion. Leur application en diagnostic de routine n’est pas encore standardisée et nécessitera encore une longue mise au point. Avec nos résultats nous apportons un éclairage nouveau sur cette introduction progressive, en association avec le SG.